Square Enix 於 11 月 6 日確認 NieR: Automata 在 Steam 有安裝問題。最新更新後，遊戲顯示下載所需的可用空間高於預期。發行商正尋找原因並處理，也為造成不便向玩家道歉。
修正推出前，公司提供暫時下載基礎遊戲的方法：在 Steam 收藏庫開啟 NieR: Automata 的內容設定，前往 DLC 分頁，取消勾選追加內容。
更新後，玩家看到約 366 GB 的可用空間要求，原先則約為 50 GB。依現有回報，異常容量與追加套件有關，似乎每個套件都加上了基礎遊戲的大小。
11 月 5 日的 Steam 版更新加入韓文、簡體中文及繁體中文支援。